Modelado molecular

Temario

1 Introducción

1.1 Generalidades

1.2 Conceptos básicos

2 Relación Estructura-Actividad

2.1 Predicción de propiedades.

3 Metodologías para Modelado Molecular 

3.1 Docking proteína-ligando

3.2 Docking proteína-proteína  

4 Tipos de bases de datos

4.1 Genbank

4.2 Uniprot

4.3 Protein Data Bank

5 Identificación y selección del blanco

6 Métodos de optimización 

6.1 Minimización de la Energía

6.2 Método Hartree Fock

6.3 Método de funcionales de la densidad (DFT)

6.4 Métodos semi-empíricos

7 Predicción de propiedades químico-biológicas

8 Interacciones Biomoleculares y Termodinámica

8.1 Cálculo de Propiedades 

8.2 Cálculo de la Energía de Asociación

9 Visualizadores de estructuras

9.1 Pymol

9.2 VMD

9.3 Chimera

9.4 Autodock

10 Interpretación y análisis de Resultados

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