Análisis Filogenéticos

Temario

1 Introducción a la filogenética

1.1 Fundamentos de biología molecular

1.2 Fundamentos de proteínas

1.3 Evolución

1.4 Génomas

1.5 Bases de filogenética

2 Introducción a la Bioinformática

2.1 Generalidades de Bioinformática

2.2 Secuenciación 

2.3 Recursos bioinformáticos disponibles en línea

2.4 Recursos bioinformáticos disponibles en modo local

3 Bases de datos

3.1 Tipos de datos y formato de datos (FASTA, FASTQ, etc).

3.2 Bases de datos en el área químico-biológica (Genbank, PDB, etc). 

4 Herramientas bioinformáticas para análisis de secuencias 

4.1 Herramientas de análisis y edición de secuencias

4.1.1 Herramientas disponibles para la visualización de cromatogramas 

4.1.2 Herramientas disponibles para la edición de secuencias

4.2 Alineamientos (globales y locales)

4.3 BLAST

4.4 Alineamientos múltiples   

5 Construcción filogenética

5.1 Predicción de genes

5.2 Predicción estructural de las proteínas

5.3 Alineamientos y reconstrucción filogenética

5.3.1 Reconstrucción filogenética: evolución mínima, Neighbor-joining y UPGMA

5.3.2.Optimización

5.3.2.1 Máxima parsimonia

5.3.2.2 Máxima verosimilitud (Mega) 

5.3.2.3 Estadística Bayesiana (Mr. Bayes)

5.3.3 Herramientas en línea y locales para construcción filogenética. 

5.4 Análisis e interpretación de datos filogenéticos moleculares.